Docker mysql 5.7 イメージで初期化処理に失敗して、ログインできない

発生したエラー

MySQL 5.7 のイメージ を使用して単純に起動しても下記エラーが発生して、初期化処理に失敗していた。
厳密には初期化時に上記エラーが出て、初期化SQLまでたどり着かなかった。

初期化処理に失敗すると、mysql userの設定や admin パスワードの設定がうまくできないようで、どうしようもない状態になるようで、、これをなんとかしたかった…

/usr/local/bin/docker-entrypoint.sh: line 137: 126 Killed "$@" --skip-networking --default-time-zone=SYSTEM --socket="${SOCKET}"

ログをみると怪しい部分は上記のみで、どうもプロセスがいきなり Kill されているように見える

原因はリソースの使いすぎ

以下のようなコメントにたどり着いた

• 1708115 – Running mysql container in moby-engine results in 100% memory usage

• Really high memory usage · Issue #579 · docker-library/mysql

  Thank you so much @evolbug!
  The bug you found put me on the right tracks. The issue is caused by the ulimit nofile.
  By default, on arch, the value is too low I guess.
  running the container with --ulimit nofile=262144:262144 solve the issue and mysql behaves normally. I guess the best way to fix this would be to set this option by default.
  
  Should this be documented on docker images prone to this issue?
  
  Edit:
  Actually, it's weird, I think the default limit is way to high, this is what I get by default:
  
  > docker run --rm centos:7 /bin/bash -c 'ulimit -Hn && ulimit -Sn'  
  1073741816
  1073741816
  So lowering the value fixes the issue

• The ulimits does the trick. I added this to my docker-compose and make it work. @vodkhard

  ulimits:
    nproc: 65535
    nofile:
      soft: 26677
      hard: 46677

結論: ulimits でリソース制限してやる

ulimits:
  nproc: 65535
  nofile:
    soft: 26677
    hard: 46677

ulimit メモ

• ulimits は Linux のコマンドで、ユーザが使用できるリソースを制限できるもの。ファイル最大サイズや、使用メモリ、使用プロセス数などを制限できる
• nproc は プロセス数の制限
• nofile は プロセスが同時に開けるファイルディスクリプタの数
  • soft は一般ユーザの上限値、hard は root ユーザの上限値
• ulimit -a で現在設定されている値を表示できる

  $ ulimit -a
  real-time non-blocking time  (microseconds, -R) unlimited
  core file size              (blocks, -c) unlimited
  data seg size               (kbytes, -d) unlimited
  scheduling priority                 (-e) 0
  file size                   (blocks, -f) unlimited
  pending signals                     (-i) 126012
  max locked memory           (kbytes, -l) 8192
  max memory size             (kbytes, -m) unlimited
  open files                          (-n) 1024
  pipe size                (512 bytes, -p) 8
  POSIX message queues         (bytes, -q) 819200
  real-time priority                  (-r) 0
  stack size                  (kbytes, -s) 8192
  cpu time                   (seconds, -t) unlimited
  max user processes                  (-u) 126012
  virtual memory              (kbytes, -v) unlimited
  file locks                          (-x) unlimited